Para o presidente da Aprosoja/MT, Glauber Silveira, se não fosse o alto custo do transporte da produção, a saca poderia obter uma melhor cotação e custar cerca de R$ 7 a mais. Exemplificando, ele lembra que a soja comercializada a R$ 28 a saca no Estado poderia chegar a R$ 35 se houvesse uma logística melhor. O alto custo do frete encarece o custo de produção e faz cair o valor do produto. A logística é um dos principais temas abordados nas palestras do Circuito Aprosoja, que fala do planejamento da safra 2010/11. Com o tema "O agronegócio no contexto político e econômico", o circuito vai percorrer 19 cidades de Mato Grosso até o dia 7 de maio, orientando os produtores.
Os trilhos da ALL, ferrovia Senador Vicente Vuolo (Ex-Ferronorte) estão em Mato Grosso no trecho de Alto Taquari a Alto Araguaia. A previsão é chegar a Rondonópolis em julho de 2012 se forem liberadas todas as licenças ambientais ainda este ano e sem condicionantes. Por enquanto, são os únicos trilhos em Mato Grosso, e o setor produtivo reclama que o preço do frete não vai melhorar se não for implantado um marco regulatório no setor e o monopólio continuar.